Bom primeiro voçe terá que fazer uma pagina em HTML que sera sua POPUP (ex: um anuncio, ou promoção de um site, etc...) ou outra linguagem qualquer, após isso voçe vai inserir no seu site o codigo abaixo.
esta seria a minha POPUP no caso voçe trocaria o endereço:
(http://www.caesarinformatica.blogspot.com)
pelo da pagina que voçe criou anteriormente.
e tambem mude o nome da pagina:
(caesarinformatica)
pelo nome da sua pagina criada.
OBS: este codigo deve ser inserido entre as tag´s (HEAD)
espero que gostem e comentem............abraços.